运用质量好价格低的海运集装箱进行各种货物的运输，已经成为我国海运中司空见惯的运输方式，这种方式本身具有突出的优势，而随着海运集装箱的出现以及进一步的发展，可以推断，未来我国海运集装箱运输将会呈现如下几种发展趋势：
一、向轻泡货、高值货方向转变
随着我国经济结构日趋合理和产业结构的调整，地区间的合理分工和协作得到加强，产品高新技术含量和高附加值产品所占的比重不断提高，机械电器和大量制成品沿海运量迅速发展，因此海运集装箱所占沿海运量的比重呈明显上升趋势，是我国沿海运输货物结构调整的重要标志。
二、向多式联运方向发展
国内海运集装箱运输快速发展的时间不长，但起点不低，一起步便朝着多式联运和综合物流的方向发展。海运集装箱运输的优势就在于能减少运输环节，减少货损货差，降低运输成本，实现一票到底、全程服务的门到门运输，这是吸引广大国内货主积极采用集装箱运输的主要原因。
三、向运输网络化方向发展
国内海运集装箱运输的网络规模迅速扩大，目前国内水路集装箱运输已基本形成了以上海为枢纽港、配以渤海湾区域的大连、天津、青岛为中心以及华南区域的广州、深圳为中心、同时开发长江流域和珠江地区的大网络，“π”字型的运输格局愈加明朗。同时，航线运输网络由沿海逐步向内河推进。
四、向科技化、专业化、大型化、集约化、规模化、方向发展
随着内贸市场需求的不断增长及货源结构的不断优化，内贸集装箱船舶的大型化趋势越来越明显。根据以往的数据表明，近几年来我国投入的船舶载箱数以及更大TEU箱位的船舶呈现逐步增长的趋势，这使得船舶在大型化方向得到了快速的发展，促使未来我国海运集装箱向大型化、集约化、专业化规模化、科技化方向发展。
总的来说，未来我国海运集装箱运输行业将会向轻泡货、高值货方向、向多式联运和运输网络化方向进行发展，并且会逐渐趋向大型化、集约化、专业化、规模化、科技化，使种类繁多的海运集装箱能够更好的为为运输行业做出更大更明显的贡献。